本城という地名は戦国期より記録が残されており、大隅国吉田院の名田名であった。
 

　江戸期には本城村となり薩摩国鹿児島郡吉田郷（外城）のうちにあって明治22年に町村制が施工されたのに伴い、吉田村の大字「本城」となり昭和47年に吉田村が町制施行し吉田町の大字となった。

　平成16年に吉田町が鹿児島市に編入され、鹿児島市の町名「本城町」となり現在に至る。​